A Secretaria Municipal da Saúde (SMS) tem por responsabilidade a gestão plena do Sistema Único de Saúde (SUS) no âmbito da cidade de Caxias do Sul, bem como para os 48 municípios de abrangência da 5ª Coordenadoria Regional de Saúde. Além das ações e serviços de saúde oferecidos ao município, o órgão é responsável pela formulação e implantação de políticas, programas e projetos que visem a promoção de uma saúde de qualidade à população usuária do SUS.

Tem como missão:
- prestar atenção integral à saúde da população da cidade, envolvendo desde a atenção aos problemas e necessidades básicas mais comuns (acolhimento, atendimento e atividades nas Unidades Básicas de Saúde), até o atendimento a casos mais complexos (atendimentos e acompanhamento em ambulatórios e serviços especializados);
- a atenção às necessidades de urgência e emergência no Pronto Atendimento 24 horas,
- a assistência hospitalar aos casos que requerem internação para cirurgias e acompanhamento mais intensivo.